本地blast教學

2023年5月21日—如果BLAST以“獨立”模式執行,則數據文件可能包含本地私有數據、下載的NCBIBLAST數據庫或兩者的組合。在算法從查詢序列中搜索並最大限度地擴展所有可能 ...,2021年2月22日—BLAST比对原理就是基于序列的相似性,推断该序列的同源基因,又根据同源基因具有相同功能,从而达到功能注释的目的,这个方法往往是有效的。,要区分2者也很简单,blast是通过blastall-p的方式调用子程序来比对搜索的,而blast+则是直接使用b...

BLAST - 定義、類型、特徵、輸出、應用

2023年5月21日 — 如果BLAST 以“獨立”模式執行,則數據文件可能包含本地私有數據、下載的NCBI BLAST 數據庫或兩者的組合。 在算法從查詢序列中搜索並最大限度地擴展所有可能 ...

blast比对软件使用

2021年2月22日 — BLAST比对原理就是基于序列的相似性,推断该序列的同源基因,又根据同源基因具有相同功能,从而达到功能注释的目的,这个方法往往是有效的。

第1节. 使用本地Blast 应用

要区分2者也很简单,blast 是通过blastall -p 的方式调用子程序来比对搜索的,而blast+ 则是直接使用blastn 或blastp 等子程序来比对搜索。另外前者用formatdb 程序来格式 ...

实习五本地BLAST

网址:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi ,选择适合自己操作系统的程序,下. 载到本地。也可直接从网络教学平台的教学材料实习五中直接下载。 B、在D 盘下创建 ...

NCBI

本文详细描述了如何使用NCBI的blast功能比对查询基因信息,通过图解的方式提供操作流程报告和结果数据分析。

构建NCBI本地BLAST数据库(NR NT等)

2017年2月21日 — 以下是copy的详细英文教学: · 1. Quick Start · 2. General Introduction · 3. Contents of the /blast/db/ directory · 4. Contents of the /blast/db/FASTA ...

本地BLAST的使用方法及基本操作步骤原创

2020年7月26日 — ... BLAST就是更好的选择,并且本地版的安全性会更高,也不需要网络支持,可以自己设置BLAST数据库,因此若是需要的话可以选择使用本地BLAST,但是要注意本地 ...

史上最全的BLAST本地化教程(一)

1. 建库 · 2. 比对 · 3. 核酸序列比对核酸数据库(blastn)以及核酸序列比对蛋白数据库(blastx) · 4. 文件格式

如何使用NCBI进行blast比对

2020年3月20日 — BLAST是生命科学研究中常用的一套在蛋白质数据库或核酸数据库中进行序列相似性比对的一套分析工具。英文全称是Basic Local Alignment Search Tool。